Eine Gemeinschaft aus hohen Beamten, Priestern, des Generals Haremhab und des Eje II., ehemaliger Wesir des Echnaton, krцnte den neunjдhrigen Tutanchaton vier Jahre nach dem Tode Echnatons zum Kцnig. Dazwischen lag wohl eine dreijдhrige Regentschaft des Semenchkare, dessen Identitдt unbekannt ist. Teilweise wird angenommen, dass sich hinter dem Namen Echnatons Witwe Nofretete verbirgt. Auf Grund seines sehr jungen Alters besteht die Vermutung, dass der Kindkцnig durch den Druck der Priesterschaft, hoher Beamter und wohl auch durch Eje, der den Titel "Gottesvater" fьhrte, stark beeinflusst wurde. Der unmьndige Kцnig war leicht dazu zu bringen, die Verehrung des Gottes Aton zu beschrдnken und die Verhдltnisse vor Echnatons "Revolution" wiederherzustellen. Dies zeigt sich in der langsamen Abwendung vom Atonkult zu Beginn und wдhrend seiner Regierungszeit. Tutanchamun nimmt bei seiner Thronbesteigung den Thronnamen "Neb-cheperu-Re" an und wird mit Anchesenpaaton, der dritten Tochter Echnatons, die somit seine Schwester oder Halbschwester war, vermдhlt. Er дnderte seinen Geburtsnamen von Tutanchaton (lebendes Abbild des Aton) in Tutanchamun (lebendes Abbild des Amun oder zu Ehren des Amun) und den seiner Gemahlin von Anchesenpaaton (sie lebt fьr/durch Aton) in Anchesenamun (sie lebt fьr/durch Amun). Nach der im zweiten Regierungsjahr vorgenommenen Aufgabe von Echnatons neu gegrьndeter Hauptstadt Achet-Aton (Tell el-Amarna), zog der Kцnigshof nach Memphis um; nicht nach Theben, wie oft fдlschlich zu lesen ist. Der bedeutendste Beleg fьr die unter Tutanchamun durchgefьhrte Politik ist seine spдter von Haremhab usurpierte Stele der Restauration, die in Karnak aufgefunden wurde. Auf ihr wird der Verfall des Reiches unter Aton beschrieben und er proklamiert die Rьckkehr zu den alten Gцttern. Im ganzen Land lдsst der junge Pharao die Tempel der alten Gцtter restaurieren. Im Luxortempel wird die Dekoration der Kolonnade vollendet, Karnak erhдlt zwei neue Kapellen und an der Sphinxallee wird wieder gearbeitet. In Medinet Habu baut er an seinem Totentempel (vielleicht der ehemalige Tempel des Anch-cheperu-Re). Von Gizeh bis nach Nubien gibt es Hinweise auf seine Bautдtigkeit. Einige dieser Denkmдler werden jedoch spдter ebenfalls von Haremhab usurpiert. Der №bergang von der Amarna-Zeit vollzog sich jedoch nicht plцtzlich: In Tutanchamuns Grab befinden sich zahlreiche Gegenstдnde, auf denen das klassische Motiv der Amarna-Zeit, Aton als lebensspendende Sonnenscheibe, zu sehen ist. Das bekannteste Beispiel ist der Thronsessel, den Tutanchamun in seinen ersten Regierungsjahren benutzte. Auch in der Kunst wirkt die Amarna-Zeit noch lange nach, was besonders an den Elementen Statik und Perspektive zu sehen ist. Somit ist eine erzwungene Abkehr von dem alten religiцsen Kurs recht unwahrscheinlich, denn in diesem Fall wдre es zu einem Bildersturm gekommen, wobei darauf geachtet worden wдre, sich genau von den alten Stilen abzugrenzen. Es gibt zahlreiche Verbindungen, so dass ƒgyptologen die Pharaonen Tutanchamun und Eje ebenfalls zur Amarna-Zeit zдhlen (manchmal differenziert durch nach Amarna). Neben Eje und Haremhab sind noch diverse andere Beamte unter Tutanchamun bezeugt. Der sьdliche Wesir war ein gewisser Usermont (Wesir) und Pentu war ein weiterer Wesir, der bisher nur von einer Topfaufschrift im Grab bezeugt ist. Eine bedeutende Persцnlichkeit war auch der Schatzhausvorsteher Maya, dessen Grab in Sakkara gefunden wurde und das reich mit Reliefs dekoriert war. Obervermцgensverwalter war Iniuia, Vizekцnig von Kusch war schlieяlich Huy, der vor allem von seinem prachtvoll dekorierten Grab in Theben bekannt ist.
